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16 avril 2011 6 16 /04 /avril /2011 09:39

 

L’équipe de recherche INRA dirigée par le Pr Dusko-Ehrlich a réussi à décrypter plus de 3 millions de gènes du microbiote intestinal.

Une performance qui permet de détecter les espèces bactériennes associés aux maladies chroniques, à l’image du rôle joué par l’hélicobacter pylori dans l’ulcère de l’estomac.

Mais la perturbation de la flore intestinale est-elle une cause ou une conséquence de la pathologie ? 


Video : 

http://www.pratis.com/shared/skins/pratis_med/modules/webtv/video_player.php?id=2555

 

 

Le séquençage du métagénome intestinal humain est réalisé à 80%

 

En 2008, une cinquantaine de chercheurs se lançaient dans l’étude MetaHIT :
l'analyse du microbiote intestinal de l'homme. Ce travail colossal, comparable au séquençage du génome humain, s’inscrit dans un vaste programme européen coordonné par Dusko Ehrlich, chercheur à l’Inra.
Neuf organismes de recherche européens, quatre industriels et un institut chinois ont été mobilisés pour cet inventaire.
Les chercheurs ont réalisé un catalogue de 3,3 millions de gènes bactériens, qui recenserait 80% de la totalité du métagénome intestinal humain.
L’étude devrait permettre de mieux appréhender l’importance de l’intestin, en dehors de la digestion. "L'ensemble des microbes présents dans le corps humain représente au moins 100 milliards de milliards de cellules, soit dix fois plus que les cellules humaines et près de cent fois plus de gènes que le génome humain, notent les auteurs de l’étude.
La majorité de ces microbes se trouvent dans notre intestin", qui jouerait un rôle clé dans l’organisation du système immunitaire.
Le poids total de la flore intestinale, qui représente un véritable écosystème propre à chaque individu, est estimé à 1,5 kg par ces chercheurs.
Dusko Ehrlich explique : "Ces nouvelles données génétiques nous permettront de mettre au point des diagnostics et d'affiner des pronostics pour de nombreuses maladies comme l'obésité, le diabète, l'autisme, la maladie de Crohn ou la rectocolite hémorragique. Une connaissance bien plus approfondie de la biologie de l'homme devrait en résulter".
Le Figaro – 05/03/10

Gastroenterol Clin Biol. 2010 Sep;34 Suppl 1:S23-8.

Metagenomics of the intestinal microbiota: potential applications.

Dusko Ehrlich SMetaHIT consortium.

 

Institut National de la Recherche Agronomique, MetaHIT coordinator, Microbiology and the Food Chain Division, Jouy-en-Josas, France. dusko.ehrlich@jouy.inra.fr

A major challenge in the human metagenomics field is to identify associations of the bacterial genes and human phenotypes and act to modulate microbial populations in order to improve human health and wellbeing.

MetaHIT project addresses this ambitious challenge by developing and integrating a number of necessary approaches within the context of the gut microbiome.

Among the first results is the establishment of a broad catalog of the human gut microbial genes, which was achieved by an original application of the new generation sequencing technology.

The catalog contains 3.3 million non-redundant genes, 150-fold more than the human genome equivalent and includes a large majority of the gut metagenomic sequences determined across three continents, Europe, America and Asia.

Its content corresponds to some 1000 bacterial species, which likely represent a large fraction of species associated with humankind intestinal tract.

The catalog enables development of the gene profiling approaches aiming to detect associations of bacterial genes and phenotypes.

These should lead to the speedy development of diagnostic and prognostic tools and open avenues to reasoned approaches to the modulation of the individual's microbiota in order to optimize health and well-being.


PMID: 20889001 [PubMed - indexed for MEDLINE]

 

 

Video : 

http://www.pratis.com/shared/skins/pratis_med/modules/webtv/video_player.php?id=2555

 


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Published by Chronimed - dans Infections froides
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